Matrix Science header

ms_datfile Member List

This is the complete list of members for ms_datfile, including all inherited members.
appendErrors(const ms_errors &src)ms_errors
checkSeqDBInstallRequest(const std::string &dbName, const double newFastaSize) const ms_datfile
clearAllErrors()ms_errors
copyFrom(const ms_datfile *right)ms_datfile
matrix_science::ms_errors::copyFrom(const ms_errors *right)ms_errors
defaultValues()ms_datfile
editedByDatabaseManager() const ms_datfile
getClusterParams() const ms_datfile
getConnectionSettings() const ms_datfile
getCronOptions() const ms_datfile
getDatabases() const ms_datfile
getErrorHandler() const ms_errors
getFileName() const ms_datfile
getFindFileTimeout() const ms_datfile
getHeaderComments() const ms_datfile
getLastError() const ms_errors
getLastErrorString() const ms_errors
getLibraryOptions() const ms_datfile
getMascotFiles() const ms_datfile
getMascotOptions() const ms_datfile
getMaxTaxonomyRules() const ms_datfile
getParseOptions() const ms_datfile
getProcessors() const ms_datfile
getTaxonomyRules(const int idx) const ms_datfile
getUniGeneOptions() const ms_datfile
getWWWOptions() const ms_datfile
IFLG_ADDMISSINGOPTIONS enum valuems_datfile
IFLG_ADDPERCOLATOROPT enum valuems_datfile
IFLG_ADDREPORTAUTO enum valuems_datfile
IFLG_DEFAULTNEWINSTALL enum valuems_datfile
IFLG_DEFAULTUPGRADE enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEAPACHEFORKOPT enum valuems_datfile
IFLG_UPDATECLUSTER enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEDBMANAGERPERLPATH enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEESTTAX enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEMSPEPSEARCHOPTS enum valuems_datfile
IFLG_UPDATENCBIHTTPS enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEPARSERULES enum valuems_datfile
IFLG_UPDATEPRIDECONTAMINANTS enum valuems_datfile
IFLG_UPDATESWISSPROT enum valuems_datfile
IFLG_UPDATETAXONOMY enum valuems_datfile
INST_FLAGS enum namems_datfile
isValid() const ms_errors
ms_datfile()ms_datfile
ms_datfile(const ms_datfile &src)ms_datfile
ms_datfile(const char *filename, const int timeoutSec=0, const matrix_science::ms_connection_settings *cs=0)ms_datfile
ms_errors()ms_errors
operator=(const ms_datfile &right)ms_datfile
read_file()ms_datfile
save_file()ms_datfile
SEQDB_INSTALL enum namems_datfile
SEQDB_INSTALL_CURRENT_RULES enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_CUSTOMISED enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_EXISTING_LARGER enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_INACTIVE enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_INVALID_CONFIG enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_INVALID_DBNAME enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_MISSING_CONFIG enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_MUST_UPDATE_CFG enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_OLD_RULES enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_SHOULD_QUERY_USER enum valuems_datfile
SEQDB_INSTALL_WRONG_WILDCARD enum valuems_datfile
setClusterParams(const ms_clusterparams *params)ms_datfile
setConnectionSettings(const matrix_science::ms_connection_settings &cs)ms_datfile
setCronOptions(const ms_cronoptions *options)ms_datfile
setDatabases(const ms_databases *dbs)ms_datfile
setFileName(const char *name)ms_datfile
setFindFileTimeout(const int seconds)ms_datfile
setHeaderComments(const std::string headerComments)ms_datfile
setLibraryOptions(const ms_libraryoptions *spectralLibraryOptions)ms_datfile
setMascotFiles(const ms_mascotfiles *src)ms_datfile
setMascotOptions(const ms_mascotoptions *opt)ms_datfile
setParseOptions(const ms_parseoptions *rules)ms_datfile
setProcessors(const ms_processoroptions *info)ms_datfile
setTaxonomyRules(const int idx, const ms_taxonomyrules *rules)ms_datfile
setUniGeneOptions(const ms_unigeneoptions *uoptions)ms_datfile
setWWWOptions(const ms_wwwoptions *www)ms_datfile
updateForInstaller(ms_errs &log, const char *not_mascot_dat_path, const char *mascot_dat_path, const char *licenseFilePath, const char *pathToMascot, const char *mascotURL, const char *sequenceDatabases, const bool clusterEnable, const WST wst, const char *NTGuestName, const char *NTAdminName, const unsigned int flags)ms_datfile
WST enum namems_datfile
WST_APACHE enum valuems_datfile
WST_IIS enum valuems_datfile
~ms_datfile()ms_datfile
~ms_errors()ms_errors
Copyright © 2016 Matrix Science Ltd.  All Rights Reserved. Generated on Fri Jun 2 2017 01:44:52