ms_taxonomyrules Member List

This is the complete list of members for ms_taxonomyrules, including all inherited members.

appendGencodeFile(const ms_taxnodesfiles *item)	ms_taxonomyrules
appendNoBreakDescLineIf(const char *str)	ms_taxonomyrules
appendNodesFile(const ms_taxnodesfiles *item)	ms_taxonomyrules
appendPerDbSrcRule(const ms_parserule_plus *item)	ms_taxonomyrules
appendPrefixRemove(const char *item)	ms_taxonomyrules
appendSpeciesFile(const ms_taxspeciesfiles *item)	ms_taxonomyrules
appendStrFile(const ms_taxspeciesfiles *item)	ms_taxonomyrules
appendSuffixRemove(const char *item)	ms_taxonomyrules
clearDBLevelTaxId()	ms_taxonomyrules
clearGencodeFiles()	ms_taxonomyrules
clearNoBreakDescLineIf()	ms_taxonomyrules
clearNodesFiles()	ms_taxonomyrules
clearPerDbSrcRules()	ms_taxonomyrules
clearPrefixRemoves()	ms_taxonomyrules
clearSpeciesFiles()	ms_taxonomyrules
clearSuffixRemoves()	ms_taxonomyrules
copyFrom(const ms_taxonomyrules *right)	ms_taxonomyrules
defaultValues()	ms_taxonomyrules
getAccFromSpeciesLine() const	ms_taxonomyrules
getDBLevelTaxId() const	ms_taxonomyrules
getDefaultRule() const	ms_taxonomyrules
getDescriptionLineSep() const	ms_taxonomyrules
getDoThisRuleFirst() const	ms_taxonomyrules
getErrorLevel() const	ms_taxonomyrules
getGencodeFile(const int index) const	ms_taxonomyrules
getIdentifier() const	ms_taxonomyrules
getNoBreakDescLineIf(const int index) const	ms_taxonomyrules
getNodesFile(const int index) const	ms_taxonomyrules
getNumberOfGencodeFiles() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfNoBreakDescLineIf() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfNodesFiles() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfPerDbSrcRules() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfPrefixRemoves() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfSpeciesFiles() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfStrFiles() const	ms_taxonomyrules
getNumberOfSuffixRemoves() const	ms_taxonomyrules
getPerDbSrcRule(const int index) const	ms_taxonomyrules
getPreceedingComments() const	ms_customproperty
getPrefixRemove(const int index) const	ms_taxonomyrules
getQuickRefSearch() const	ms_taxonomyrules
getSpeciesFile(const int index) const	ms_taxonomyrules
getSpeciesFormatRegex(const TAX_SPECIES_FORMAT format) const	ms_taxonomyrules
getSrcDatabaseRule() const	ms_taxonomyrules
getStrFile(const int index) const	ms_taxonomyrules
getStrRule() const	ms_taxonomyrules
getSuffixRemove(const int index) const	ms_taxonomyrules
isConcatRefFileLines() const	ms_taxonomyrules
isDBLevelTaxId() const	ms_taxonomyrules
isEnabled() const	ms_taxonomyrules
isFromRefFile() const	ms_taxonomyrules
isMitochondrialTranslation() const	ms_taxonomyrules
isSectionAvailable() const	ms_taxonomyrules
ms_customproperty()	ms_customproperty
ms_taxonomyrules()	ms_taxonomyrules
ms_taxonomyrules(const ms_taxonomyrules &src)	ms_taxonomyrules
operator=(const ms_taxonomyrules &right)	ms_taxonomyrules
setAccFromSpeciesLine(const ms_parserule *src)	ms_taxonomyrules
setConcatRefFileLines(const bool flag)	ms_taxonomyrules
setDBLevelTaxId(const int value)	ms_taxonomyrules
setDefaultRule(const ms_parserule_plus *src)	ms_taxonomyrules
setDescriptionLineSep(const char value)	ms_taxonomyrules
setDoThisRuleFirst(const ms_parserule *src)	ms_taxonomyrules
setEnabled(const bool flag)	ms_taxonomyrules
setErrorLevel(const int value)	ms_taxonomyrules
setFromRefFile(const bool flag)	ms_taxonomyrules
setIdentifier(const char *str)	ms_taxonomyrules
setMitochondrialTranslation(const bool flag)	ms_taxonomyrules
setPreceedingComments(const std::string &comments)	ms_customproperty
setQuickRefSearch(const char *str)	ms_taxonomyrules
setSectionAvailable(const bool value)	ms_taxonomyrules
setSpeciesFormatRegex(const TAX_SPECIES_FORMAT format, const std::string regex)	ms_taxonomyrules
setSrcDatabaseRule(const ms_parserule *src)	ms_taxonomyrules
setStrRule(const ms_parserule_plus *src)	ms_taxonomyrules
~ms_customproperty()	ms_customproperty
~ms_taxonomyrules()	ms_taxonomyrules