00001 /*
00002 ##############################################################################
00003 # file: ms_distiller_master_search.hpp
00004 # 'msparser' toolkit
00005 # An extracted ion chromatogram
00006 ##############################################################################
00007 # COPYRIGHT NOTICE
00008 # Copyright 1998-2014 Matrix Science Limited  All Rights Reserved.
00009 #
00010 ##############################################################################
00011  * @(#)$Source: parser/inc/ms_distiller_master_search.hpp $
00012  * @(#)$Revision: 1b450440f9c97e1e41d0fc6016a27d68951d4532 | MSPARSER_REL_2_8_1-0-gea32989045 $
00013  * @(#)$Date: 2018-07-30 16:23:53 +0100 $
00014 ##############################################################################
00015  */
00016 
00017 #ifndef MS_DISTILLER_MASTER_SEARCH_HPP
00018 #define MS_DISTILLER_MASTER_SEARCH_HPP
00019 
00020 
00021 // Includes from the standard template library
00022 #include <string>
00023 
00024 
00025 namespace msparser_internal
00026 {
00027     class ms_XMLHelper;
00028     class ms_XMLElement;
00029 }
00030 
00031 namespace matrix_science
00032 {
00033     //=========================================================================
00039 
00040 
00043     class MS_MASCOTRESFILE_API ms_distiller_master_search
00044     {
00045         public:
00046             // used internally
00047             ms_distiller_master_search();
00048             virtual ~ms_distiller_master_search() { }
00049 
00050             bool extractXml(msparser_internal::ms_XMLHelper & helper, msparser_internal::ms_XMLElement & element);
00051 
00053             virtual int getId() const;
00055             virtual std::string getCacheFilename() const;
00056 
00058             virtual int getNumSubsearches() const;
00060             virtual const ms_distiller_subsearch & getSubsearch(int index) const;
00061 
00063             virtual std::string getCombinedPeptideSummaryCacheStreamName() const;
00064 
00065         private:
00066             int id;
00067             std::string cacheFilename;
00068             std::vector<ms_distiller_subsearch> subsearches;
00069     };
00070  // end of quantitation_group
00072     //=========================================================================
00073 
00074 } // namespace matrix_science
00075 
00076 #endif // MS_DISTILLER_MASTER_SEARCH_HPP
00077 
00078 /*------------------------------- End of File -------------------------------*/