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ms_quant_average.hpp

00001 /*
00002 ##############################################################################
00003 # file: ms_quant_average.hpp                                               #
00004 # 'msparser' toolkit                                                         #
00005 # Encapsulates average-element from "quantitation.xml"-file                #
00006 ##############################################################################
00007 # COPYRIGHT NOTICE                                                           #
00008 # Copyright 1998-2006 Matrix Science Limited  All Rights Reserved.           #
00009 #                                                                            #
00010 ##############################################################################
00011  * @(#)$Source: parser/inc/ms_quant_average.hpp $
00012  * @(#)$Revision: 1b450440f9c97e1e41d0fc6016a27d68951d4532 | MSPARSER_REL_2_8_1-0-gea32989045 $
00013  * @(#)$Date: 2018-07-30 16:23:53 +0100 $
00014 ##############################################################################
00015  */
00016 
00017 #ifndef MS_QUANT_AVERAGE_HPP
00018 #define MS_QUANT_AVERAGE_HPP
00019 
00020 
00021 // forward declarations
00022 namespace msparser_internal {
00023     class ms_quant_xmlloader;
00024 }
00025 
00026 namespace matrix_science {
00027 
00028     class ms_xml_schema; // forward declaration
00029 
00035 
00036 
00039     class MS_MASCOTRESFILE_API ms_quant_average: public ms_quant_parameters
00040     {
00041         friend class msparser_internal::ms_quant_xmlloader;
00042     public:
00044         ms_quant_average();
00045 
00047         ms_quant_average(const ms_quant_average& src);
00048 
00050         virtual ~ms_quant_average();
00051 
00053         void defaultValues();
00054 
00056         void copyFrom(const ms_quant_average* right);
00057 
00058 #ifndef SWIG
00059 
00060         ms_quant_average& operator=(const ms_quant_average& right);
00061 #endif
00062 
00063         virtual std::string getSchemaType() const;
00064 
00066         virtual std::string validateShallow(const ms_xml_schema *pSchemaFileObj) const;
00067 
00069         virtual std::string validateDeep(const ms_xml_schema *pSchemaFileObj) const;
00070 
00071 
00073         bool haveNumPeptides() const;
00074 
00076         int getNumPeptides() const;
00077 
00079         void setNumPeptides(int value);
00080 
00082         void dropNumPeptides();
00083 
00085         std::string getNumPeptidesSchemaType() const;
00086 
00087 
00089         bool haveSelection() const;
00090 
00092         std::string getSelection() const;
00093 
00095         void setSelection(const char* value);
00096 
00098         void dropSelection();
00099 
00101         std::string getSelectionSchemaType() const;
00102 
00103 
00105         bool haveReferenceAccession() const;
00106 
00108         std::string getReferenceAccession() const;
00109 
00111         void setReferenceAccession(const char* value);
00112 
00114         void dropReferenceAccession();
00115 
00117         std::string getReferenceAccessionSchemaType() const;
00118 
00119 
00121         bool haveReferenceDatabase() const;
00122 
00124         std::string getReferenceDatabase() const;
00125 
00127         void setReferenceDatabase(const char* value);
00128 
00130         void dropReferenceDatabase();
00131 
00133         std::string getReferenceDatabaseSchemaType() const;
00134 
00135 
00137         bool haveReferenceAmount() const;
00138 
00140         std::string getReferenceAmount() const;
00141 
00143         void setReferenceAmount(const char* value);
00144 
00146         void dropReferenceAmount();
00147 
00149         std::string getReferenceAmountSchemaType() const;
00150     private:
00151 
00152         int _numPeptides;
00153         bool _numPeptides_set;
00154 
00155         std::string _selection;
00156         bool _selection_set;
00157 
00158         std::string _referenceAccession;
00159         bool _referenceAccession_set;
00160 
00161         std::string _referenceDatabase;
00162         bool _referenceDatabase_set;
00163 
00164         std::string _referenceAmount;
00165         bool _referenceAmount_set;
00166     }; // class ms_quant_average
00167  // end of config_group
00169 
00170 } // namespace matrix_science
00171 
00172 #endif // MS_QUANT_AVERAGE_HPP
00173 
00174 /*------------------------------- End of File -------------------------------*/

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