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tools_shapiro_wilk.pl

Using the Shapiro-Wilk W test algorithm.

#!/usr/local/bin/perl
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# file: tools_shapiro_wilk.pl                                                #
# Mascot Parser toolkit example code                                         #
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# COPYRIGHT NOTICE                                                           #
# Copyright 1998-2010 Matrix Science Limited  All Rights Reserved.           #
#                                                                            #
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#     $Source: /vol/cvsroot/parser/examples/test_perl/tools_shapiro_wilk.pl,v $
#     $Author: villek $
#       $Date: 2010/08/31 08:48:07 $
#   $Revision: 1.3 $ 
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use strict;
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use msparser;

my $sw = new msparser::ms_shapiro_wilk;

$sw->appendSampleValue(-0.1420);
$sw->appendSampleValue(-0.1184);
$sw->appendSampleValue(-0.0583);
$sw->appendSampleValue(-0.0402);
$sw->appendSampleValue(-0.0363);
$sw->appendSampleValue(-0.0363);
$sw->appendSampleValue(-0.0348);
$sw->appendSampleValue(-0.0333);
$sw->appendSampleValue(-0.0222);
$sw->appendSampleValue(-0.0139);
$sw->appendSampleValue(-0.0114);
$sw->appendSampleValue(-0.0042);
$sw->appendSampleValue(-0.0036);
$sw->appendSampleValue(-0.0026);
$sw->appendSampleValue( 0.0000);
$sw->appendSampleValue( 0.0016);
$sw->appendSampleValue( 0.0058);
$sw->appendSampleValue( 0.0077);
$sw->appendSampleValue( 0.0084);
$sw->appendSampleValue( 0.0102);
$sw->appendSampleValue( 0.0132);
$sw->appendSampleValue( 0.0172);
$sw->appendSampleValue( 0.0180);
$sw->appendSampleValue( 0.0191);
$sw->appendSampleValue( 0.0194);
$sw->appendSampleValue( 0.0200);
$sw->appendSampleValue( 0.0246);
$sw->appendSampleValue( 0.0293);
$sw->appendSampleValue( 0.0533);
$sw->appendSampleValue( 0.0987);

$sw->calculate(30,30,15);
my $fmt = "%16s W = %8.6f and P = %8.6f%s\n";
printf $fmt, "Test should give", 0.892184, 0.0054, '';
printf $fmt, "Results:", $sw->getResult, $sw->getPValue(), "; error code = " . $sw->getErrorCode();

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