欢迎来到第101期

期待在德克萨斯州休斯顿的ASMS与您相遇，届时我们将举办年度用户会，也欢迎您到726展位参观交流。

本月的特色文章研究了微量金属离子对磷酸化肽段定量的负面影响以及解决方法。如果您近期有发表文章，并且希望列举在下一期的Newsletter中，请将相关的PDF文档或URL链接发给我们。

我们也在庆祝Matrix Science成立25周年。巧合的是，2023年3月的newsletter正好是发行的第100期。

如果您有任何意见或问题，请随时联系我们。

Matrix Science在ASMS

我们很高兴邀请您参加6月5日星期一上午7:00 - 8:00在德克萨斯州休斯顿举行的ASMS年度用户会议，会议将包括以下报告：

• Special guest presentation – Professor Susan Weintraub, University of Texas Health Science Center at San Antonio
• Single cell proteomics with Mascot – Patrick Emery, Matrix Science
• 25 years of Matrix Science – Ville Koskinen, Matrix Science

用户会议是免费的，但是需要提前注册，我们将提供早餐。请点击链接进行注册。

使用Mascot发表的特色文章

在这里，我们重点介绍了最近有趣且重要的文章，该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定，定量或表征，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发送给我们PDF或URL。

Bioinertization of nanoLC/MS/MS systems by depleting metal ions from the mobile phases for phosphoproteomics

Yumi Komori, Tomoya Niinae, Koshi Imami, Jun Yanagibayashi, Kenichi Yasunaga, Shinya Imamura, Masami Tomita, Yasushi Ishihama

Molecular & Cellular Proteomics, in press, 2023

作者们开发了一种方法，通过将金属离子对峰形失真和信号强度降低的影响最小化来改善磷酸化肽段的分析。该方法还可以消除一些可能抑制电离并引起非必要沉淀的添加剂的影响。

约3600种不同的磷酸化肽段被用作模型底物，以研究金属离子对微量样品中蛋白质磷酸化定量的影响。磷酸化肽段通过填充TiO₂磁珠的羟基酸修饰的金属氧化物色谱法从HeLa细胞提取物的酶切样本中富集而来。作者分别测试了肽段溶液在不锈钢、钛和PEEK三种常见色谱材料上的吸附作用，并发现多重修饰的磷酸化肽段在不锈钢和钛填充材料中，回收率分别降低了4.3倍和5.4倍，而从PEEK中回收率接近100％。当溶剂过泵之后，他们发现金属离子的影响受到显着抑制，而不过泵的溶剂没有这种效果。

他们测试了离线螯合树脂柱，发现对金属离子的去除有效。因此，尝试开发了一种在线金属离子去除系统，使用螯合树脂柱制备Empore亚胺基乙酸酯固定化膜片并将其插入PEEK联合件中，然后将其放置在nanoLC泵和样品注射器之间。在线装置的下游使用无金属PEEK和熔融硅玻璃毛细管。磷酸化肽段的峰面积通过在线金属离子去除装置平均增加了9.9倍，而对于多重磷酸化肽段，峰面积平均增加了77倍。

Matrix Science 25周年

Matrix Science成立25年了。自1998年John Cottrell和David Creasy成立公司以来，时过境迁，如今的蛋白质组学与当时的科学前沿相比显然有了很大的不同。

从Matrix Science授权Darryl Pappin和David Perkins(英国帝国癌症研究基金会)开发的MOWSE III（Molecular Weight Search）算法开始，Mascot搜索引擎现在每年被超过2000篇论文引用。有成千上万的人信任Mascot，并且Mascot至今已有数百万个搜索结果。

任何公司或者产品的成功都来源于种种因素，但毫无异议的是，没有用户的支持，任何产品都无法长久发展下去。感谢所有在过去四分之一个世纪的时间里，对Mascot产品信任与支持的用户，也很感谢大家在使用过程中提供的体验反馈、bugs以及改进建议等，让Mascot能不断优化，为大家提供优质的数据分析平台。

您可以在Blog中阅读更多关于我们的历史以及技术和产品的发展历程。

About Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

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