欢迎

我们期待在即将于加利福尼亚州阿纳海姆举行的ASMS 会议上见到大家。报名参加将于6月3日举行的 Matrix Science 用户会，并在219号展位与我们会面。

您是否在 ASMS 上展示使用 Mascot 的海报或演讲？将海报/演讲编号、演讲者姓名和摘要发送至newsletter@matrixscience.com，我们将在将来的Newsletter中对其进行专题报道。

本月的重点文章将介绍，使用人工神经网络来优化样品制备工作流程。

25 年来，我们一直向公众提供 Mascot Server的免费公开访问。

Mascot: 深受客户信赖25年的蛋白质质谱鉴定标准参考软件

申请试用

Matrix Science在ASMS

今年 6 月，我们将在加利福尼亚州阿纳海姆举行的 ASMS 会议上的 219 号展台展示 Mascot 的最新进展。

欢迎参加 6 月 3 日举行的年度 ASMS 用户会。参加会议不收取任何费用，但需提前注册。人数有限，因此建议尽早报名。会议将提供早餐。

6 月 3 日星期一，上午 7:00 – 上午 8:00
加利福尼亚州阿纳海姆市，阿纳海姆会议中心 213A 室

• Preview of Mascot Server 2.9,
  Ville Koskinen, Matrix Science

• Custom reporting with Mascot Distiller,
  Patrick Emery, Matrix Science

• Automatically running reports with the Mascot Daemon Export Extender,
  Richard Jacob, Matrix Science

现在注册

使用Mascot发表的特色文章

在这里，我们重点介绍了最近有趣且重要的文章，该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定，定量或表征，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发送给我们PDF或URL。

Refinement of paramagnetic bead-based digestion protocol for automatic sample preparation using an artificial neural network

Sergio Ciordia, Fatima Milhano Santos, Joao M.L. Dias, Jose Ramon Lamas, Alberto Paradela, Gloria Alvarez-Sola, Matías A. Avila, Fernando Corrales

Talanta 274, 1 July 2024, 125988

作者研究了SP3 (Single-Pot Solid-Phase-enhanced Sample Preparation)方法中中影响蛋白质提取和质谱分析消化效率的六个因素。目的是根据胰蛋白酶和Lys-C的浓度、消化缓冲液中ACN的百分比、消化时间以及珠子的数量和SDS的百分比，最大限度地提高HeLa蛋白质组中无漏切的肽段的鉴定数量。

他们围绕一系列这些因素进行了30次实验，并利用这些实验训练了一个人工神经网络模型 (ANN)，以找到能够最大化鉴定多肽的最佳条件。人工神经网络能够预测最佳参数，而无需对每种因子组合进行实验，同时减少了繁琐费力的人工步骤。

消化 50 μg HeLa 提取物的最佳条件是：2.5% SDS、300 μg 珠子、0.15 μg Lys-C 和 2.5 μg 胰蛋白酶长期消化（16 小时）。然后将这些条件调整到 OT-2 自动化平台，使用自动和手动工作流程，鉴定到的无漏切的肽段数量分别为 36,614 和 36,708 个。自动工作流程显示出极高的重现性，而且在其他类型的样品（包括人血浆、拟南芥叶、大肠杆菌细胞和小鼠组织皮层）上的也表现出具有良好的重现性和低变化性。

25年来免费的Mascot 服务

我们免费提供公共Mascot服务已有 25 年之久。自 1999 年以来，数以万计的人已经完成了超过 2700 万次的数据库搜索（还在继续增加！）。

我们之所以能够免费提供这项服务，得益于我们在 Mascot 服务器中内置的几项功能：

• 专为远程使用而设计 – 搜索提交、报告和大多数管理任务均可通过网络浏览器完成的。

• 完全自动化 – 系统设置完毕后，几乎不需要手动管理。

• 在商用硬件上运行 – 任何标准的Intel/AMD 服务器都适用。

• 系统依赖性低 – 可使用任何 Windows 或 Linux 版本。

• 容错性 – Mascot 能够处理无效、错误和不完整的输入。

• Mascot Security – 自动对并发访客搜索的大小和数量应用限制，以确保每个人都能获得公平的份额。

此外，我们始终运行 Mascot Server 的最新零售版本，因此您可以确信您的结果是最好的。当然，如果您想自动提交搜索、执行大型搜索、搜索其他序列数据库或自定义配置，则需要购买本地许可证。

我们希望您继续享受这项免费服务。在我们的博客中阅读更多信息，包括有关最近硬件升级的新闻。

About Matrix Science

Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助大家更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot每年被2000 多篇论文引用，软件全线支持来自Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo Scientific和Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系我们或我们的营销合作伙伴，了解如何利用 Mascot 推动蛋白质组学研究的更多信息。

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