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欢迎

我们很高兴在近期于马里兰州巴尔的摩市举行的ASMS会议上见到大家。以下是我们年度用户会议的概要,包括Mascot DIA预览。

我们收录了部分利用Mascot进行蛋白质鉴定、定量或表征的ASMS海报并在会上展示。

Matrix Science在ASMS上展示了两张关于将机器学习应用于非标记定量研究的海报。

 

June 2025, #127

ASMS用户会
Mascot在ASMS
Matrix Science海报
关于Matrix Science
 

 

Mascot:25 年来值得信赖的质谱蛋白质鉴定参考标准

申请试用

 

年度用户会总结

 

我们在早餐会上举行了一场特邀报告和两场由Matrix Science 带来的技术报告

Using MS2Rescore to boost identification rates in complex samples.

根特大学/VIB-UGent医学生物技术中心的Tim Van Den Bossche描述了MS2Rescore的工作原理,并展示了使用机器学习进行重评分的优势。

Mascot DIA: Universal spectrum-centric approach.

Matrix Science 的Ville Koskinen展示了Mascot Server和Mascot Distiller下个版本中计划支持的DIA功能。

Mascot DIA: Thermo LFQ example.

Matrix Science 的Patrick Emery使用即将发布的Mascot Server 3.2(测试版)和Mascot Distiller 3.0(测试版),分享了针对一个Thermo Orbitrap DIA项目的初步分析结果。

Illustration for blog summary

 

 

精选的使用Mascot的ASMS报告

以下是ASMS会议上一些利用Mascot进行蛋白质鉴定、定量或表征的有趣报告。由于会议每天都有数百个海报,因此我们无法在此列出所有Mascot海报。

 

MP 282 Species identification of the DNA-degraded blood drop in the complex matrices by nanoLC-MS/MS

Katarzyna Staniszewska, Malgorzata Hopcias, Paulina Kret, Piotr Suder

陈旧的微小血迹在挑战性材料载体上仍可实现物种溯源,即使DNA已完全降解或受污染。

AGH University of Krakow

TP 135 Quantitative Proteomics of Silva Patterns and the Tumor Microenvironment in Cervical Adenocarcinomas

Jonathan Ogata, Sarah M. Drayer, Sean Cronin, Jordyn Tumas, Saeid Movahedi-Lankarani, Tamara Abulez, Kelly A. Conrads, Brian L. Hood, Jordan Driscoll, Kathleen M. Darcy, Christopher M. Tarney, G. Larry Maxwell, Thomas P. Conrads, Nicholas W. Bateman, Neil T. Phippen

定量蛋白质组分析揭示了侵袭性Silva C亚型宫颈腺癌特有的肿瘤及基质蛋白异常。

Inova Henry M. Jackson Foundation

WP 675 Identification and quantification of 4-HNE-adducted proteins to study the metabolic disorders of the ALDH2 gene mutation

Fu-An Li, Ling Hui Wang

ALDH2突变通过4-羟基壬烯醛(4-HNE)加合损害褐色脂肪组织(BAT)功能,导致能量消耗降低和饮食诱导性肥胖,ALDH2激活剂可逆转此效应。

Academia Sinica

WP 176 Evaluation of antioxidant properties, untargeted metabolomics profiling and protein identification using Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) across various Thai rice varieties

Jaruwan Chimasangkanan, Worakrit Saiyasombat, Wimonphan Chathiran, Pattaraporn Morasin, Warangkana Srichamnong

本研究旨在探讨发芽与未发芽条件下,有色(红、紫、黑)及无色水稻的代谢组学特征。此外,研究通过FRAP、DPPH及总抗氧化剂检测试剂盒评估抗氧化性能,并分析发芽水稻中蛋白质表达模式及蛋白质鉴定结果。

Mahidol University

ThP 097 Monitoring the estrogen-inducible proteins in Lake trout (Salvelinus namaycush) from Great Lakes upon exposure to environmental contaminants

Taniya Modhishika Jayaweera, Krishan S Weraduwage, Bernard Crimmins, Sujan Fernando, Thomas M Holsen, Costel C. Darie

本项目的核心目标之一是监测湖鳟鱼(Salvelinus namaycush)和大眼狮鲈(Sander vitreus)在接触环境污染物(大湖区内)时,特定肝脏蛋白的表达情况。目前尚无监测鱼类体内内分泌干扰物(EDCs)影响的方法;本研究将首次建立此类监测体系。

Clarkson University

 

 

Matrix Science poster presentations

 

Matrix Science在ASMS海报展示会上展示了两份海报。PDF版文件可免费 从我们的网站下载。

TP 505: Customizable machine learning adapter improves LFQ in Mascot Distiller.

Mascot Distiller 中的非标记定量分析现可利用机器学习进一步优化结果。通过使用基准 DDA LFQ 数据集演示了该workflow。

ThP 265: Machine learning-enabled Mascot Server API improves LFQ in client software like Thermo Proteome Discoverer.

Mascot Server 可将优化后的结果导出至其他软件平台(如 Thermo Proteome Discoverer)。在机器学习支持下,非标记定量分析的准确度与精准度保持稳定的同时,定量到的蛋白质数量显著提升。

Illustration of Mascot tip

 

 

About Matrix Science

Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助大家更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot每年被2000 多篇论文引用,软件全线支持来自Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo Scientific和Waters质谱仪生成的质谱数据。

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