欢迎

ASMS 会议马上就要开始了，我们盛邀您参加6月6日和7日在圣安东尼奥举办的早餐会。

这个月出版的特色文章中，作者利用Orbitrap，开发了一种能够对组蛋白进行深度分析并增加其覆盖度的方法。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的Newsletter中，请发给我们 相关的PDF 或者URL.

本月Mascot小技巧将告诉您，当您的搜索在一天后无端崩溃时，该如何处理。

如果你有任何建议和问题，请随时 联系我们。

在圣安东尼奥加入我们——ASMS

6月，ASMS将在圣安东尼奥举办，我们盛邀您届时参加我们的早餐会议。我们将举办两场会议，到时您可以学习关于数据库搜索及定量的最新应用和发展。早餐会是免费的，但是您需要提前注册。

6月6日（周一）： 7:00 am - 8:00 am

Ancient proteomes - proteomics in archaeology, palaeontology and forensics 报告人： Michael Buckley（曼彻斯特大学，Manchester University）

Mass tolerant and error tolerant searches: how do they compare? 报告人 Matrix Science

6月7日（周二）： 7:00 am - 8:00 am

From Samples to Biomarker Discovery: The keys for Large Scale Proteomics 报告人： John Corthesy（雀巢健康科学研究院Nestlé Institute of Health Sciences）

New features in Mascot Distiller - MS^E, MS3 reporter ion quant, and more 报告人 Matrix Science

点击这里获取详情并注册。

使用Mascot发表的优秀文章

这里我们列举了近期一篇很有意思的，也很重要的文章。该文章运用Mascot进行了蛋白鉴定，定量及特性分析。如果您也想让我们列举您的文章，请将文章的 PDF 或者URL 发送给我们。

Analyses of Histone Proteoforms Using Front-end Electron Transfer Dissociation-enabled Orbitrap Instruments

Lissa C. Anderson, Kelly R. Karch, Scott A. Ugrin, Mariel Coradin, A. Michelle English, Simone Sidoli, Jeffrey Shabanowitz, Benjamin A. Garcia and Donald F. Hunt

Molecular & Cellular Proteomics (2016), 15, 975-988

组蛋白是染色体中主要的蛋白成分，通过复杂的翻译后修饰、组蛋白突变以及蛋白降解，在基因表达的调控中发挥着主要功能。为了克服当前基于MS 技术，表征组蛋白中的一系列限制，本文作者利用改进的Orbitrap 仪器，开发了一种新的技术线路。

在Orbitrap仪器前安置一个试剂离子源，利用C-trap储存来源于多重迭代反应的碎片离子,研究者能够在很大程度上增强碎片离子流。碎片离子流经过有效聚集后，被转移至Orbitrap中进行测定。这一改进策略能够增强信号-噪声比，能够在与LC 匹配的时间轴上获取更高质量的图谱。

Hela细胞经丁酸盐处理后，研究者利用top-down LC/MS/MS技术，采用 ETD碎裂模式，对其中的组蛋白进行分析。几种特征性的组蛋白proteoforms 被鉴定，序列覆盖度最高达到81%，其中包括多种修饰，例如单氨基酸替换，甲基化以及乙酰化。另外，组氨酸H2A和H2B的截断形式也被表征，序列覆盖度高达93%。

本月Mascot小技巧

我们时不时的会接到Mascot Server的用户报告说，他们的搜索崩溃了。当我们试图寻找崩溃的原因时，我们发现这种崩溃现象总是在搜索开始约86400s 后发生，这个时间相当于1天。其实原因是IIS，也就是Windows 网页服务器造成的。当安装Mascot时，Mascot CGI 过程的延时时间会从默认的900s 增加至1天，大多数情况下，1天的时间已经绰绰有余 了，但是不排除少数情况。

如果您的搜索可能需要更多的时间，而您又正在使用IIS7或更新的版本，您可以通过以下操作简便地增加延时时间。Windows开始菜单——控制面板——管理工具——互联网信息服务（IIS） 管理。在树状结构的文件栏中，点击扩展Sites ，然后点击扩展Default web site, 选择Mascot。在中间面板中，双击CGI图标。CGI 延时界面就会呈现，然后对其编辑。需要注意的是，定义1天的格式是：1.00:00:00。 如果您想更改，在Action 中选择Apply。

对于IIS6（XP 以及2003服务器），您必须使用脚本来实现上述的更改。具体步骤参照Mascot 安装及设置手册中的附件 D（按照您本地Mascot 主页上的链接）。

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

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