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你有来自不同厂商的仪器么?Mascot Distiller 为您提供高质量谱峰挑选,序列de novo,定量等一站式解决方案。

这个月的案例文章描绘了一种利用MALDI-TOF MS快速鉴定E.coli 所属亚种的方法。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的Newsletter中,请发给我们 相关的PDF 或者URL。

本月的Mascot小技巧告诉你如何定制用户所需的修饰,例如常用修饰简表中的内容。

如果你有任何建议和问题,请随时 联系我们。

 

2015.09

Mascot Distiller
特色文章
本月Mascot小技巧
 

用Mascot Distiller 简化数据分析流程

Mascot Distiller 中集成了很多非常有用的功能——原始数据浏览,高质量的谱峰挑选,序列de novo,MS1定量,查看搜索结果。其中最强大的功能包括:能够处理来自所有主流生厂商仪器的原始数据,包括Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo 以及Waters。如果您实验室有来自多家生产商的仪器,利用一款软件处理所有格式的数据将是最节省时间的方法。

您可以申请 30天免费试用 来体验Distiller如何简化您的数据分析流程。

这里有全新的 教程 来帮助您提升谱峰选择的速度。您也可以将典型的原始文件发送给我们,我们将为您优化提取参数。

Mascot Distiller

使用Mascot发表的优秀文章

这里我们列举了近期一篇很有意思的,也很重要的文章。该文章运用Mascot进行了蛋白鉴定,定量及特性分析。如果您也想让我们列举您的文章,请将文章的 PDF 或者URL 发送给我们。

 

Rapid, Sensitive, and Specific Escherichia coli H Antigen Typing by Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight-Based Peptide Mass Fingerprinting.

Huixia Chui, Michael Chan, Drexler Hernandez, Patrick Chong, Stuart McCorrister, Alyssia Robinson, Matthew Walker, Lorea A. M. Peterson, Sam Ratnam, David J. M. Haldane, Sadjia Bekal, John Wylie, Linda Chui, Garrett Westmacott, Bianli Xu, Mike Drebot, Celine Nadon, J. David Knox, Gehua Wang and Keding Cheng

J. Clin. Microbiol. (2015), vol. 53, 2480-2485

这篇文章描述了一种利用高特异性,高灵敏度的MALDI-TOF MS 平台在亚种水平上快速鉴定Escherichia coli 鞭毛抗原(H抗原)的方法。

MALDI-TOF-MS与血清型的结果比较显示, MALDI-TOF-MS 在E. coli H抗原的鉴定和确定亚型上,是一种精确且灵敏的方法。MALDI-TOF-MS准确鉴定了参考菌株中所有53个E. coli H 型。在85个MALDI-TOF测试的临床分离株中,75株鉴定的H 型(88.2%)与传统的血清型结果匹配。相比血清型分型,这一新方法具有更短的周转时间,更高的通量,更低的成本。

Thumbnail from featured publication

本月Mascot小技巧

Mascot 从 Unimod 中下载修饰列表,Unimod中包含了1351条修饰信息。在过去,如果您想改变常用修饰简表中的修饰信息,或者改变“error tolerant search”中的修饰信息,这一过程是有些痛苦的,而且您修改的信息会随着您更新本地unimod.xml文件而丢失。

Configuration editor中的修饰模块在Mascot Server 2.5中进行了很大的改进。现在,您可以非常容易的添加或删除简表中,或者“error tolerant search”中使用的修饰信息。最棒的是,即使unimod.xml更新,其中包含了新的修饰信息,或者修饰发生了变化,这些修改仍然会被记住。

如果您正打算升级至Mascot Server 2.5,请查看 technical support page, 来了解如何保存您之前的修改。

configuration editor

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助他们更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自AB Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

 

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