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很高兴在圣安东尼奥的ASMS会议上见到了大家。如果您未参加我们的早餐会议，会议的报告内容可在线获取。

本期内容我们将介绍新发布的Mascot Distiller 中几大重要的进展。

这个月出版的特色文章中，作者利用核糖体分析以及蛋白组学技术鉴定了细菌中表达基因的翻译起始位点。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的Newsletter中， 请发给我们 相关的PDF 或者URL.

本月Mascot小技巧告诉您为什么在高负荷的Windows server上，搜索会崩溃。

如果你有任何建议和问题，请随时 联系我们。

Mascot Distiller 2.6 已发布

这个月初，我们发布了新版的 Mascot Distiller, 一个可以和Mascot Server 互补的多功能分析软件。Distiller 读取来自所有仪器供应商的原始文件，进行谱峰提取，提交搜索，基于信号强度，对非标或标记的样品进行定量。

该新版本的改进包括:

• 可以支持Waters MS^E 数据，包括定量。
• 利用MS³ 扫描谱图，对报告离子进行定量（iTRAQ, TMT）
• 根据扫描形式将扫描谱图累加或合并。
• Sciex ClearCore library 可以更快速的提取Wiff 文件中的谱图。
• 根据扫描形式，用不同的离子序列搜索谱峰列表。
• 全面修改优化了默认处理参数文件

想要了解更多新版本的功能，请点击这里 。您也可以 申请Mascot Distiller 30天免费试用.

使用Mascot发表的优秀文章

这里我们列举了近期一篇很有意思的，也很重要的文章。该文章运用Mascot进行了蛋白鉴定，定量及特性分析。如果您也想让我们列举您的文章，请将文章的 PDF 或者URL 发送给我们。

Mass spectrometry-based absolute quantification reveals rhythmic variation of mouse circadian clock proteins

Ryohei Narumi, Yoshihiro Shimizu, Maki Ukai-Tadenuma, Koji L. Ode, Genki N. Kanda, Yuta Shinohara, Aya Sato, Katsuhiko Matsumoto, and Hiroki R. Ueda

PNAS (2016) 113, E3461, online: May 31, 2016

本研究观察了哺乳动物系统中的核心的生物钟蛋白质，并且基于SRM靶向蛋白组学技术对这些蛋白质进行了定量分析。本文作者应用了基于LC/MS的“同位素标记的无细胞产物定量（MS-QBiC）”法，该方法利用重组的无细胞蛋白合成系统，用于高通量的制备标准内参。

对小鼠进行2周的昼夜循环饲养后，收集小鼠肝脏，用120个QBiC 肽段，对6个时间点的样品进行了分析。在24小时的时间轴上，20个从小鼠肝脏中挑选的生物钟蛋白中，16个蛋白被成功定量，其中14个蛋白具有昼夜变化。该研究指出，单个时间点可以预测身体时间，表明每个昼夜节律的蛋白是人体身体时间检测的潜在生物标志物。

本月Mascot小技巧

在系统高负荷的情况下，在Windows server上进行Mascot 搜索会随机的发生崩溃。在低负荷的时间重复同样的搜索，则会成功。IIS 日志中包含Timer_MinBytesPerSecond 报错信息。

这问题是由于服务器与用户之间的交互非常慢导致的。在最近的版本中，IIS最小值被设定为240bytes/sec。如果交互速率低于这个阈值，IIS则会取消这次搜索。

对于IIS 7.0或更晚的版本(Vista 之后)，你可以从Windows 控制面板中，关闭这个阈值:

• IIS 管理
• 选择服务器
• 配置编辑器
• Section: 选择 system.applicationHost/webLimits
• 将 MinBytesPerSecond 设置为 0
• 应用并重启IIS

对于IIS 6.0(Windows Server 2003以及Windows XP Pro x64)，设置MinFileBytesPerSec。 KB919797 描述了如何关闭它。

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

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