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我们正在开发新型母离子检测技术，用于实现基于谱图中心的DIA谱图肽段鉴定。

本月的重点文章介绍了通过牙齿与骨骼重建中世纪修道院的饮食结构。

微软已宣布将于2025年10月14日终止Windows 10的主流支持，此举将影响Mascot Server 2.6及2.7版本。

Mascot：25 年来值得信赖的质谱蛋白质鉴定参考标准

申请试用

Mascot DIA中的母离子检测技术

我们正在开发一种用于分析DIA数据的以谱图为中心的通用型解决方案—Mascot DIA。该方案包含一种全新的母离子检测算法，将在即将发布的Mascot Distiller 3.0中实现。

在DIA模式下，仪器会对选定隔离窗口内的所有母离子进行碎裂。软件面临的核心挑战是如何确定这些母离子的质量数——因为原始文件仅存储了隔离窗口的边界值。传统方法是先通过序列数据库或谱图库列出所有理论母离子质量数，再尝试匹配隔离窗口内的所有质量数。而我们正在开发的新型算法可直接从MS/MS扫描中观测到的峰推断母离子质量数。

该算法的核心原理是：从MS/MS扫描谱图中筛选互补离子对，并加合它们的质量数。这样就能得到潜在母离子的[M+H]+质量数加上额外质子形成的m/z值，最终可转换为母离子m/z值。若在隔离窗口内针对某个母离子m/z值发现足够数量的互补峰对，则将其添加为候选母离子。完成所有峰对处理后，将筛选出最优候选母离子进行数据库检索。

与传统方法相比，该技术具有以下优势：

• 无需母离子质量数及其对应保留时间的谱库
• 支持任意酶切方式和可变修饰
• 即使基于centroid化数据也能确定母离子质量和电荷数
• 基本不受碎裂效率影响
• 适用于所有互补离子系列（如b/y型和c/z型离子）

如需了解更详细的比较分析，敬请访问我们的博客。

使用Mascot 发表的特色文章

在这里，我们重点介绍了最近有趣且重要的文章，该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定，定量或表征，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发送给我们PDF或URL。

Reconstructing medieval diets through the integration of stable isotope and proteomic analyses from two European burial sites

通过稳定同位素与蛋白质组学分析技术重建两处欧洲墓葬遗址的中世纪饮食模式

A. Pedergana, J. Grossmann, R. Turck, A. Goujon, F. Rühli, S. Wilkin, P. Eppenberger, C. Lehn

Scientific Reports, 15, Article number: 26442 (2025), doi:10.1038/s41598-025-10103-0

人牙中的稳定同位素数据可揭示个体童年时期的饮食信息，而肋骨则能用于判断成年期的平均膳食构成。但该方法仅能提供粗略的概览。

牙结石是牙齿表面矿化的生物膜，其中可能储存来自动植物来源的多种脂质与蛋白质。研究者分析了采集自德国达尔海姆和瑞士两处中世纪修道院墓地的牙结石、牙本质及骨骼样本，旨在验证从牙结石中获得的饮食推断结果是否与胶原蛋白中的稳定同位素数据相关联。

稳定同位素数据显示，达尔海姆人群主要依赖陆地动物蛋白，并同时食用以C3类植物为主的农作物。虽然同位素分析未提供食用鱼类或豆类的明确证据，但蛋白质组学数据确认了这两种食物在膳食中的存在。鉴定出的生物分类包括普通小麦、大麦、小米、青豆和欧洲鲈鱼。然而两处遗址牙结石样本中膳食蛋白的检出率相对较低——从15个个体中仅复原出16种膳食蛋白（含34个唯一肽段）。尽管两种分析方法互为补充，作者特别指出必须考虑蛋白质结构在牙结石膳食蛋白差异性保存中的重要影响。

Windows 10支持服务即将终止

微软已宣布将于2025年10月14日终止对Windows 10的主流支持。若您当前在Windows 10系统上运行Mascot Server 2.8或3.x版本，我们建议您升级至Windows 11系统。

需要注意的是，如果您使用的是Mascot Server 2.6或2.7版本，由于第三方Perl模块的缺陷，这些版本与Windows 11存在兼容性问题。您可以选择继续使用Windows 10系统，但将无法再获得操作系统的安全更新。若必须升级Windows系统，则需同步更新至完全兼容Windows 11的Mascot Server 3.1版本。

要查询当前版本号，请访问本地Mascot主页并选择" Database Status "选项，版本信息将显示在页面顶部。

本次升级恰逢最佳时机：自7月1日起，Mascot Server已推出三种新规格（小型/中型/大型）活动，且版本更新成本大幅降低。版本升级服务还包含为期一年的尊享支持——提供远程技术支持及专业的安装/迁移指导。如需了解更多详情或获取报价，请发送邮件至support@cloudscientific.com 与我们联系。

About Matrix Science

Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助大家更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot每年被2000 多篇论文引用，软件全线支持来自Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo Scientific和Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系我们或我们的营销合作伙伴，了解如何利用 Mascot 推动蛋白质组学研究的更多信息。

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