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在某些环境下，单点登录可以增强安全性并缓解登录疲劳。

本月的特色文章分析了用于捕获磷酸肽的锆和磁性钛粒子。如果您有近期发表的文章，希望列举在下一期的Newsletter中，请将相关的PDF文档或URL链接发给我们。

本月的Mascot小贴士重点关注处理可变修饰的参数。

如果您有任何意见或问题，请随时联系我们。

Mascot 单点登录的安全性

Mascot Server通常在需要不同级别安全和隐私的个人或团体之间共享。尽管Mascot Security提供了对结果报告、数据库甚至自定义修饰的访问限制机制，但下决心要黑你的黑客可能不会遇到太大困难就能找到绕过它的方法。

如果对于您来说安全性是一个值得关切的点，我们建议将您的Mascot Server放在防火墙后面，或者使用强大的身份验证系统限制访问。一种方法是使用单点登录(SSO)系统，在这种系统中，您只需要对自己进行一次身份验证就可以访问一系列应用程序和软件系统。Mascot Server与这些系统是兼容的，因为它没有直接与验证系统集成；所有繁重的工作都是由web服务器来完成的。

web浏览器将有关用户的信息发送到web服务器，然后web服务器将与身份验证系统交互。如果身份验证成功，web服务器将把经过身份验证的用户名传递给Mascot Security用户数据库。如果用户存在，他们就可以登录到Mascot Server上，无需提示输入密码。

必须确保Mascot用户名与外部用户名匹配，并且Mascot用户必须配置为使用web服务器身份验证。点击这里阅读关于设置SSO的更多细节。

使用Mascot发表的优秀文章

在这里，我们重点介绍了最近有趣且重要的文章，该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定，定量或表征，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发送给我们PDF或URL。

Zirconium(IV)-IMAC Revisited: Improved Performance and Phosphoproteome Coverage by Magnetic Microparticles for Phosphopeptide Affinity Enrichment

Ignacio Arribas Diez, Ireshyn Govender, Previn Naicker, Stoyan Stoychev, Justin Jordaan, and Ole N. Jensen

J. Proteome Res. 2021 20(1) 453-462

作者研究了溶剂条件对蛋白质酶解产物中磷酸化肽富集的影响。他们将Zr-IMAC磁性微粒与Ti-IMAC和TiO₂在6种不同的羟基酸溶液中的富集性能进行了比较，并用LC-MS/MS对保留下来的肽段进行了表征。

通过自动化的磷酸肽富集和LC - MS/MS对人HepG2/C3A细胞的胰蛋白酶酶解产物最佳富集方法(Solvent2/Zr-IMAC、Solvent3/Ti-IMAC和Solvent1/ TiO₂)进一步评估。在此条件下，Zr-IMAC比Ti-IMAC(4072)和TiO₂(2744)提取出更多的磷酸肽(4624)。

S2/Zr-IMAC、S3/Ti-IMAC和S1/TiO₂富集方法共鉴定出5173个磷酸化肽段。几乎一半的磷酸肽(44%)可以被三种方法重现(2278)。S2/Zr-IMAC获得最多的方法特异磷酸肽(829个)，占总数的16%。

然后他们将这些方法与标准的基于LC的Fe-IMAC方法进行了比较。虽然鉴定出的总肽数相似，但磁微粒富集的选择性要高得多，超过90%的总肽被归属为磷酸化肽，而Fe-IMAC高效液相色谱法的富集选择性仅为78%。

Mascot 小贴士

在Mascot Server2.7版本中对于修饰的处理变得更加精细。有三个参数用于优化更大的速度或更大的分析深度:

• MaxPepNumVarMods 用于设置单个肽上允许的最大可变修饰数。默认设置3。但是，如果你研究的是一个高度修饰的蛋白，例如组蛋白，或者是比较长的肽段，您可以以牺牲搜索速度为代价来增加这个值。
• MaxPepNumModifiedSites 每个肽的最大修饰残基数是多少。与MaxPepNumVarMods类似的考虑也适用于更改默认值5。
• MaxPepModArrangements 是单个可变修饰组合的最大排列数。如果修饰分析在您的鉴定中不十分重要，您可能希望减少默认值64。

关于这些参数如何影响搜索结果的例子，可以阅读我们最近的一篇博客文章。

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

请联系康昱盛以获取更多的信息。

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