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Mascot 服务器现在可通过新的转换脚本 blib2msp,搜索 BiblioSpec BLIB 格式的谱图库。

本月精选研究聚焦于利用果蝇表达的 PET 水解酶对 PET 塑料的降解过程。

我们在伦敦的办公室已搬迁,请及时更新您的通讯录。

 

2026.03, #136

MSP到BLIB转换器
使用Mascot发表的特色文章
伦敦办公室搬迁
关于Matrix Science
 

 

Mascot:25 年来值得信赖的质谱蛋白质鉴定参考标准

申请试用

 

将 BLIB 谱图库转换为 NIST MSP 格式

 

Mascot Server能够创建并搜索 NIST MSP 格式的谱图库。然而许多谱图库采用不同的文件格式,因此无法直接兼容。例如,作为 Skyline 软件一部分的 BiblioSpec,其使用的便是 BLIB 格式。

为此,我们开发了一个名为 blib2msp 的脚本,用于将 BLIB 文件转换为 MSP 文件。这意味着 Mascot Server现在可以搜索由 Skyline(BiblioSpec)生成的DDA谱图库,以及由 Carafe 等工具生成的in silico谱图库。

您还可以使用 blib2msp 将 Mascot Server生成的 NIST MSP 格式文件转换为 BLIB 格式。Skyline 本身已支持读取 NIST(.MSP)文件,但转换为 BLIB 格式的 MSP 谱图库对其他谱图库搜索引擎可能更为实用。这种转换使得同一谱图库无论源自何处,都能在多个平台上被一致地使用。

完整说明及 Matrix Science GitHub 仓库的链接详见我们的博客

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使用Mascot 发表的特色文章

在这里,我们重点介绍了最近有趣且重要的文章,该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定,定量或表征,如果您想要您的文章也在这里重点推荐,请发送给我们PDF或URL

 

Polyethylene terephthalate degradation by Drosophila melanogaster through heterologous expression of glycosylated polyethylene terephthalate hydrolase (PETase)

黑腹果蝇通过异源表达糖基化PET水解酶实现聚对苯二甲酸乙二醇酯的降解

Rikako Sanuki, Hatsune Minami, Emi Kawano, Keita Katsuma, Toshiyuki Takano-Shimizu-Kouno, Shosuke Yoshida

Communications Sustainability volume 1, Article number: 36 (2026), doi:10.1038/s44458-026-00047-5

广泛使用的塑料——聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)的回收通常依赖于高能耗的化学工艺。PET水解酶,例如源自大阪堺菌(Piscinibacter sakaiensis)的PET水解酶(PETase),已被提出作为实现生物法PET回收的替代方案。

研究者探索了利用昆虫作为PET生物降解平台的可行性,通过基因工程改造黑腹果蝇(Drosophila melanogaster),使其在部分肠道和唾液腺中表达PETase。实验结果表明,该体系能够降解水溶性PET共聚物以及固态PET。研究发现,在果蝇和人类细胞中表达的PETase均发生了糖基化修饰,这种修饰虽降低了酶的催化活性,但增强了酶的稳定性,使其能够更持久地维持PET水解作用。

为了解析N-糖基化模式,研究者对去糖基化处理后的胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶解肽段进行了液相色谱-串联质谱(LC–MS/MS)分析。利用Mascot Server对所得谱图进行检索,通过检测酶处理后糖基化天冬酰胺残基转化为天冬氨酸所引起的去糖基化诱导的质量偏移,来鉴定糖基化位点。其中,在Asn-X-Ser/Thr基序内发生脱酰胺化的天冬酰胺残基被视为N-糖基化位点。该方法成功鉴定了PETase序列中的N-糖基化位点,并确认了在真核表达系统中这些特定残基发生了修饰。

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英国办公室的地址变更

 

Matrix Science Ltd 自 1998 年起总部位于英国伦敦。此前不久,我们在英国的办公室地址还是贝克街 64 号。

如今,我们已搬迁至同一条街往北一个街区的全新办公场所。新地址为:

Matrix Science Ltd
83 Baker Street
London, W1U 6AG
United Kingdom

我们的其他联系方式保持不变,电话号码和邮箱地址均未变动。

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About Matrix Science

Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助大家更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot每年被2000 多篇论文引用,软件全线支持来自Agilent, Bruker, Sciex, Shimadzu, Thermo Scientific和Waters质谱仪生成的质谱数据。

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