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我们开设了一个新的栏目，叫做“How do I do that？”，该栏目罗列了10条Mascot操作中的小技巧， “寻找非特异性的修饰“是其中之一。

这个月列举的文章展示了一种选择性分析人类血浆中糖蛋白的新方法。如果您最近也有文章发表并且希望我们列举在下一期的Newsletter中，请发给我们 相关的PDF 或者URL。

最近，我们更新了网上培训课程的视频。

如果你有任何建议和问题，请随时 联系我们。

How Do I Do That?

在最近的ASMS会议上，我们整理了10条有用的Mascot小技巧，并且做了报告。这里，我们只罗列了其中3个技巧:

• 寻找非特异性的修饰 - 你可能会想要创建一种不确定位点的修饰，例如FuzzyMod(ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY)。如果你尝试搜索这种修饰，大量的组合种类会造成组合爆炸，Mascot很有可能会耗尽内存或地址空间，然后崩溃。你需要做的是…
• 代谢标记的样品 - 搜索来自代谢标记的样品，例如15N或者13C，你需要选择一种定量方法，即使你可能对定量并不感兴趣。
• 在你的Mascot Server上释放磁盘空间 - 不管你的磁盘有多大，总有一天空间会被用尽。你可以下载一个脚本，它可以帮助您定期删除历时缓存文件，压缩结果文件，从而恢复您的磁盘空间。

阅读更详细的信息以及其他7个小技巧，请看 How Do I Do That?

使用Mascot发表的优秀文章

这里我们列举了近期一篇很有意思的，也很重要的文章。该文章运用Mascot进行了蛋白鉴定，定量及特性分析。如果您也想让我们列举您的文章，请将文章的 PDF 或者URL 发送给我们。

Simultaneous Enrichment of Plasma Soluble and Extracellular Vesicular Glycoproteins Using Prolonged Ultracentrifugation-Electrostatic Repulsion-hydrophilic Interaction Chromatography (PUC-ERLIC) Approach

Esther Sok Hwee Cheow, Kae Hwan Sim, Dominique de Kleijn, Chuen Neng Lee, Vitaly Sorokin and Siu Kwan Sze

Molecular & Cellular Proteomics (2015) 14: 1657-1671.

该文章的作者研究了循环系统中的糖蛋白以及从损伤或者感染的宿主细胞或者组织中分泌出来的细胞外囊泡，它们是鉴定人类疾病状态的潜在生物标志物。该研究显示，通过PUC-ERLIC富集的糖蛋白，能够同时覆盖人类血浆（没有去除高峰度蛋白）中分泌的糖蛋白以及来自细胞外囊泡的糖蛋白。

在一次LC-MS/MS分析中，作者在人类血浆样品中鉴定了127个糖蛋白，包括599个特异性糖肽以及361个特异性糖基化位点。在不事先去除高峰度蛋白的情况下，PUC-ERLIC能够鉴定48个低丰度蛋白（pg/ml-ng/ml）。通过分析心脏病病人的血清，他们发现了一个心脏特异性重建的糖蛋白——LYVE1——该蛋白已经被报道参与心肌层的愈合。

更新的培训课程

不管您是数据库搜索的新手还是寻找特定信息的经验丰富的行家，我们的 在线培训课程模块 提供了许多有用信息，完善和补充了帮助页面（help page）中的资料。所有的模块都已经更新，体现了Mascot2.5中的最新功能。 点击该链接 直接获取在线视频。

结束学习之后，有一个 多项选择测试。 准确率达到75%及以上，您可以获得属于个人的通过证书。

关于 Matrix Science

Matrix Science 为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助他们更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot 软件全线支持来自AB Sciex, Agilent, Bruker, Shimadzu, Thermo Scientific 以及 Waters质谱仪生成的质谱数据。

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